San José.- El Instituto Costarricense de Investigación y Enseñanza en Nutrición y Salud (Inciensa) realizó la secuenciación de genoma del primer caso de viruela símica en el Costa Rica, siendo el único país en lograrlo descifrarlo dentro del istmo centroamericano, según el Ministerio de Salud.
Secuenciar el virus revela se puede el “clado” al que pertenece (una rama genética) y con ello, se determina su severidad.
“Los clados se han asociado con diferentes grados de severidad de la enfermedad y tasas de mortalidad: para el clado 1, se reporta una letalidad de una de cada 10 personas infectadas en los países de África central. El clado 2 y 3 causa una enfermedad más leve y una tasa de mortalidad más baja.”, detalló Francisco Duarte, coordinador del laboratorio de genómica y biología molecular del Inciensa.”
El primer caso de viruela del mono pertenece al clado 3, lo que significa que es leve con una mortalidad “estimada en alrededor del 1%”, según Duarte.
Justamente el que está produciendo el reciente brote de la enfermedad a nivel mundial. En el país apenas se registran tres casos.
El equipo multidisciplinario del laboratorio de genómica del Inciensa y sus colaboradores de la UCR son los mismos que vigilaron la evolución del covid-19.
Para determinar la secuencia del genoma, seleccionaron los protocolos de laboratorio y evaluaron las estrategias bioinformáticas para analizar los datos de la secuenciación.
La muestra se secuenció por la técnica de metagenómica en escopeta (del inglés shotgun metagenomics); consiste en tomar la muestra del paciente, hacer una extracción de todo el material genético presente (ADN del paciente, del microbiota acompañante y del virus), secuenciarlo por la tecnología de secuenciación de siguiente generación y posteriormente, realizar los análisis computacionales (bioinformáticos), identificar el material genético del virus y se reconstruir su genoma.
Estas estrategias permiten generar y contextualizar los resultados genómicos de los casos que se puedan secuenciar en Costa Rica e interpretarlos a la luz de la epidemiología genómica global para seguimiento del brote.
El Centro Nacional de Referencia de Virología (CNRV), de Inciensa, anunció que coordinará con la red de laboratorios tanto públicos y privados para identificar los posibles casos de esta enfermedad, con el fin de que el sistema de salud pueda aplicar las medidas de prevención y control adecuadas.
